Un an après la fin de sa carrière, Fernando Morientes retrouve le Real Madrid, où il s'est révélé entre 1997 et 2005. L'ancien compère de Raul à la pointe de l'attaque des Merengue rejoint le centre de formation des champions d'Espagne comme l'annonce Marca. Il est nommé entraîneur des Juvenil B (16-18 ans) et aura notamment sous ses ordres un certain Enzo Zidane.