On connaît le fétichisme de Wes Anderson. Que se soit le chapeau de Max dans RUSHMORE, la bille de BB gun coincée dans la main de Chas Tenenbaum ou les lunettes du père dans le DARJELING LIMITED, un objet n'est jamais qu'un objet : il est l'ambassadeur d'une thématique et d'une ambiance. Qu'Anderson consacre sa première adaptation au tout premier livre qu'il ait possédé n'est donc qu'une demi-surprise. Outre la fascination du réalisateur pour cette histoire de Roald Dahl, le prestige de FANTASTIC MR. FOX à ses yeux se rattache indubitablement à ce souvenir d'enfance marquant : celui du premier livre.

En plus de son talent, la sincère admiration de Wes Anderson pour l'imaginaire de Dahl a beaucoup touché Felicity Dahl. Quand elle rencontra le réalisateur pour la première fois, la veuve de l'auteur se souvient de s'être dit « que ce garçon semblait avoir toutes les qualités requises pour faire ce film. De plus il ressemblait à Mr. Fox, très bien habillé et impeccable. » Une fois le projet en lancé, Anderson s'installe à Gipsy House, la maison où Dahl écrivait toutes ses histoires. Selon Allison Abbate, la productrice, ces deux séjours, dont le second fut consacré à l'écriture du scénario avec son ami Noah Baumbach, « ont beaucoup contribué à créer sa vision du film. Il y a plein de petits détails amusants dans le film qui lui ont été directement inspirés par cette maison et la campagne alentour. »

Dès le début, Anderson avait pour ambition de réaliser un film d'animation en stop-motion. Le producteur Jeremy Dawson commente ce choix en expliquant : « Il aime le fait que ce soit fait à la main, le côté artisanal. » Car ce qu'il ne voulait pas c'était d'une « d'une animation lisse et parfaite. Il voulait faire ressentir aux spectateurs la matérialité des marionnettes et des décors, et leur faire comprendre comment est fait le film. », fait remarquer Mark Gustafson, le directeur de l'animation.